南方醫(yī)科大學(xué)深圳醫(yī)院消化科以學(xué)科共建的形式，把國家臨床重點專科南方醫(yī)科大學(xué)南方醫(yī)院消化科優(yōu)勢技術(shù)移植到深圳醫(yī)院基地。按照大學(xué)附屬醫(yī)院和三甲醫(yī)院的高標(biāo)準(zhǔn)嚴要求建設(shè)與發(fā)展消化科。 　　目前除了能開展消化系統(tǒng)臨床常見病和危重病診療之外，已經(jīng)開展了無痛胃腸鏡檢查、膠囊內(nèi)鏡檢查、超聲內(nèi)鏡檢查、胃腸道早期癌的篩查、胃腸息肉或早期癌的內(nèi)鏡下治療（EMR、ESD）、消化道支架植入、消化道狹窄擴張術(shù)、食管胃的間質(zhì)瘤治療（STED）、賁門失遲緩癥內(nèi)鏡下治療（POEM）、胰膽管逆行造影與膽管取石（ERCP、ENBD）、雙氣囊小腸鏡檢查等高級內(nèi)鏡下的診療技術(shù)。