兒科為敦煌地區(qū)集臨床、科研、教學為一體兒童診療中心。多年來承擔敦煌地區(qū)兒科疑難、危重癥的診治及搶救及下級醫(yī)院轉診工作。共開放床位36張。擁有多參數(shù)監(jiān)護儀、嬰兒培養(yǎng)箱溫箱、新生兒紅外線輻射搶救臺，藍光治療箱，無創(chuàng)脈氧監(jiān)護儀，微量血氣分析儀，微量快速血糖分析儀，經(jīng)皮膽紅素測定儀，微量輸液泵、嬰兒氧艙等先進診療儀器及設備。新生兒病區(qū)為敦煌地區(qū)最早開設的具專科實力的新生兒病區(qū)，通過與北京兒童醫(yī)院、天津總醫(yī)院兒科建立幫扶與合作，積累了豐富的臨床經(jīng)驗，各類新技術的應用，使新生兒重度窒息、肺出血、顱內出血等危重癥搶救成功率大大提高， 　　兒科非常重視學科建設，近年來先后有5項課題分別獲酒泉地區(qū)科技進步獎2、3等獎，發(fā)表于國家或省級雜志的學術論文達數(shù)十篇以上。全科醫(yī)務人員以病人為中心，救死扶傷，全心全意無私奉獻為宗旨，在本地區(qū)享有較高的聲譽。