眼科有專用的診斷、治療診區(qū)，寬大整潔的治療室滿足各種特殊治療需求，HIV/AIDS患者白內(nèi)障、青光眼、眼外傷、眼底病等均能夠在上海市（復(fù)旦大學(xué)附屬）公共衛(wèi)生臨床中心得到滿意的服務(wù)和治療；科室均有獨立的消毒室使消毒滅菌流程更加規(guī)范化。杜絕一切可能的醫(yī)院感染和職業(yè)暴露途徑，自2006年8月以來分別購置了裂隙燈、眼底照相機、非接觸眼壓計、全自動電腦驗光-角膜曲率儀、眼前節(jié)數(shù)碼裂隙燈照相儀、電腦視野儀、眼部A/B超、手術(shù)顯微鏡、全自動高壓滅菌器。