藥學(xué)部設(shè)有門(mén)診藥房、急診藥房、兒科藥房、中藥房、病區(qū)藥房、靜脈用藥調(diào)配中心藥庫(kù)、臨床藥學(xué)、制劑生產(chǎn)、質(zhì)檢檢測(cè)等部門(mén)?，F(xiàn)有藥學(xué)專(zhuān)業(yè)技術(shù)人員147名，其中臨床藥學(xué)團(tuán)隊(duì)37名，含主任藥師2名，副主任藥師5名；博士學(xué)歷7名，碩士學(xué)歷16名，碩士生導(dǎo)師1名。 　　2017全年調(diào)配處方量7977273張，醫(yī)囑審核173776次，優(yōu)化臨床藥物治療的用藥建議2799次，為患者提供用藥教育25523人次，靜脈藥物沖配724587袋，制劑生產(chǎn)1593801支，TDM及藥物相關(guān)個(gè)體化基因檢測(cè)21720例次。 　　2010年12月，藥學(xué)部成為全國(guó)首批五家國(guó)家重點(diǎn)臨床藥學(xué)專(zhuān)科建設(shè)單位之一，獲得全國(guó)醫(yī)院藥事管理優(yōu)秀獎(jiǎng)等獎(jiǎng)項(xiàng)。2018年獲批上海市臨床重點(diǎn)專(zhuān)科（展兩翼）建設(shè)項(xiàng)目。2018年成立上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院臨床藥學(xué)創(chuàng)新研究院。2016、2017年度中國(guó)醫(yī)院最佳專(zhuān)科聲譽(yù)排行榜中，新華臨床藥學(xué)連續(xù)進(jìn)入全國(guó)排名前十。 　　近五年，藥學(xué)疑難病例會(huì)診、優(yōu)化用藥方案的數(shù)量持續(xù)增長(zhǎng)；創(chuàng)新開(kāi)展藥學(xué)門(mén)診，合理用藥前置審方系統(tǒng)，基于TDM和基因檢測(cè)的精準(zhǔn)用藥方案設(shè)計(jì)等工作。建設(shè)移動(dòng)藥師信息系統(tǒng)、藥品物流條碼追溯系統(tǒng)、冷鏈管理平臺(tái)、不良反應(yīng)監(jiān)測(cè)平臺(tái)、iPharma智能藥學(xué)服務(wù)平臺(tái)，秀麗線(xiàn)蟲(chóng)模式動(dòng)物藥物篩選平臺(tái)等，有效保障醫(yī)療質(zhì)量和用藥安全。 　　藥學(xué)部每年為全國(guó)培養(yǎng)多名優(yōu)秀的臨床藥師。2006年起為衛(wèi)生部首批十九家臨床藥師培訓(xùn)基地之一，2017年成為中華醫(yī)學(xué)會(huì)臨床藥師和師資培訓(xùn)中心。每年舉辦全國(guó)性藥學(xué)論壇和國(guó)家級(jí)繼續(xù)教育項(xiàng)目，培養(yǎng)基層藥師，為帶動(dòng)臨床藥學(xué)發(fā)展發(fā)揮積極作用。 藥學(xué)部多項(xiàng)特色技術(shù)在全國(guó)處于領(lǐng)先水平，及2017年例數(shù)如下：（1）精準(zhǔn)技術(shù)支持的個(gè)體化用藥方案制訂19949例；（2）用藥教育23427例；（3）臨床用藥咨詢(xún)、患者用藥咨詢(xún)1302例；（4）藥學(xué)會(huì)診1464例；（5）全醫(yī)囑審核173776條；（6）治療藥物優(yōu)化建議2799例；（7）藥物專(zhuān)項(xiàng)病史調(diào)查3334例；（8）藥學(xué)門(mén)診隨訪(fǎng)、在線(xiàn)用藥指導(dǎo)815例；（9）多重用藥醫(yī)囑重整907例；（10）藥品不良反應(yīng)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)及干預(yù)：肝腎功能異常1786例；（11）藥品物流安全保障平臺(tái)；（12）針劑自動(dòng)機(jī)分揀系統(tǒng)；（13）iPharma智能用藥大數(shù)據(jù)挖掘系統(tǒng)；（14）智能核對(duì)與用藥宣教系統(tǒng)；（15）LIMS實(shí)驗(yàn)室數(shù)據(jù)溯源管理系統(tǒng)；(16) 耐藥菌敏感藥物篩選系統(tǒng)；（17）新華e藥-藥學(xué)服務(wù)平臺(tái)。 　　2017年開(kāi)展積極疑難病例綜合治療和多學(xué)科診療（MDT），包括成人重癥感染，兒童重癥感染，慢性疼痛，老年危重患者及孕產(chǎn)婦危重患者等多種疾病類(lèi)型。 　　藥學(xué)部設(shè)立了抗感染、抗凝管理、兒科疾病與發(fā)育、代謝相關(guān)疾病、腫瘤和疼痛等五個(gè)亞專(zhuān)科。 　　亞專(zhuān)科一：抗感染。參與感染患者的查房，在重癥感染患者的診療、會(huì)診和MDT團(tuán)隊(duì)中發(fā)揮出藥師的作用，近五年共提出抗感染治療意見(jiàn)4000多條。并通過(guò)開(kāi)展治療藥物濃度檢測(cè)（TDM），解決復(fù)雜重癥患者的抗感染方案設(shè)計(jì)和用藥安全監(jiān)護(hù)，共計(jì)500多次。 　　亞專(zhuān)科二：抗凝管理。通過(guò)基因檢測(cè)制定個(gè)體化用藥方案，以及藥師門(mén)診對(duì)患者隨訪(fǎng)，提高藥物治療的安全性和有效性。截止2017年11月份，調(diào)整用藥方案1256例，用藥建議25792例，其中12157例為抗血栓藥物的基因檢測(cè)報(bào)告。藥學(xué)部為“中國(guó)抗血栓藥物治療聯(lián)盟理事單位”，參與中國(guó)抗血栓藥物治療標(biāo)準(zhǔn)化工作。 　　亞專(zhuān)科三：兒科疾病與發(fā)育。開(kāi)展了兒童患者呼吸、神經(jīng)、血液、腎臟、消化等系統(tǒng)疾病的藥學(xué)監(jiān)護(hù)、藥物治療方案干預(yù)、用藥教育與咨詢(xún)；為重癥患兒提供藥學(xué)會(huì)診。發(fā)展血藥濃度監(jiān)測(cè)、基因檢測(cè)等技術(shù)，開(kāi)設(shè)兒童藥物咨詢(xún)門(mén)診，提供個(gè)體化、精細(xì)化藥學(xué)服務(wù)。 　　亞專(zhuān)科四：代謝相關(guān)疾病。臨床藥師共提出代謝疾病相關(guān)藥物治療意見(jiàn)500余條。通過(guò)開(kāi)展治療藥物濃度檢測(cè)（TDM）和基因檢測(cè)技術(shù)，解決復(fù)雜代謝疾病患者的用藥方案設(shè)計(jì)和用藥安全監(jiān)護(hù)，共計(jì)500多次。 　　亞專(zhuān)科五：腫瘤和疼痛。與疼痛科成立聯(lián)合門(mén)診，在腫瘤科成立癌痛示范病房（GPM），與臨床醫(yī)生討論確定最適合的治療方案，分析藥物相互作用，并為患者一對(duì)一疼痛教育及疼痛藥物用藥教育。利用基因檢測(cè)技術(shù)，為腫瘤患者提供個(gè)體化的用藥方案，目前已開(kāi)展腫瘤藥物基因檢測(cè)500余例。