中國人民解放軍聯(lián)勤保障部隊第969醫(yī)院以原253、291醫(yī)院為基礎(chǔ)調(diào)整組建而成。營區(qū)中以原第253醫(yī)院歷史最為悠久，是我黨我軍第一所醫(yī)院，1933年始建于江西瑞金，時稱中央紅色醫(yī)院，先后參加過長征、抗日戰(zhàn)爭、解放戰(zhàn)爭和抗美援朝戰(zhàn)爭，首任院長是中國人民解放軍和新中國醫(yī)療衛(wèi)生事業(yè)的奠基人、創(chuàng)始人之一傅連暲。先后經(jīng)過次多調(diào)整整編，2018年11月組建中國人民解放軍聯(lián)勤保障部隊第969醫(yī)院。1997年被原總后勤部評定為三級甲等醫(yī)院，2014年順利通過軍隊“三甲”醫(yī)院復審。醫(yī)院先后被表彰為全國擁政愛民模范單位、全國學雷鋒先進單位、全國三八紅旗集體；被原總部表彰為“神舟載人航天飛行衛(wèi)勤保障先進單位”、“全軍為部隊服務先進醫(yī)院”?，F(xiàn)有兩個院區(qū)，即呼市院區(qū)（位于內(nèi)蒙古自治區(qū)呼和浩特市新城區(qū)愛民街111號）和包頭院區(qū)（位于包頭市東河區(qū)康復路）。